Z hľadiska efektívnejšej kontroly a koordinácie všetkých aspektov súvisiacich s plánovaním a organizovaním presunov a prepravy a využívania síl a prostriedkov ozbrojených síl bolo nevyhnutné, aby vznikol orgán vojenskej dopravy, priamo podriadený Generálnemu štábu OS SR. Preto dňom 1. novembra 2016, ako jeden z mnohých krokov, nevyhnutných v komplexnom procese transformácie vojenskej logistiky, vzniklo Národné centrum  vojenskej dopravy OS SR (pretransformovaním Odboru vojenskej dopravy ÚLZ OS SR) v Bratislave.

Vznik NCVD má opodstatnenie z pohľadu jasnej identifikovateľnosti tzv. národného centra pre koordináciu presunov a prepráv (National Movement Coordination Centre NMCC) v štruktúrach OS SR zo strany zahraničných partnerov, jednotného riadenia integrovanej medzinárodnej a vnútroštátnej dopravy pod jedným odborným riadiacim orgánom, rovnako tak aj zabezpečenie flexibility a efektivity pri odbornom raste príslušníkov vojenskej dopravy ozbrojených síl a čo je najdôležitejšie, ich udržanie v systéme.